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损失

真菌毒素通常占世界作物年损失的5%-10%， 考虑到欧盟范围内小麦、玉米和燕麦自2005年来平均产量达到2.03亿吨（价值约330亿欧元），由此推算损失可达到每年至少10亿欧元。

欧盟境内年产小麦约1.33亿吨（价值29,038,000欧元）、玉米约68亿吨（价值13,571,000欧元）和燕麦约8亿吨（价值1,543,000欧元）。通过最新的多元分析方法研究表明近乎100%的作物受到一种或多种真菌毒素的污染。按照真菌毒素造成5%-10%的损失估算，这将造成就小麦一项12-24亿欧元的损失 ，每降低1%的损失将节约1.2-2.4千万欧元。

家畜接触真菌毒素也可能导致重大的经济损失。虽然农业牲畜真菌毒素中毒症有定期的通报，就牲畜健康与繁殖力和在动物饲料方面造成的损失，很难做出精确的估计。然而若干刊物为此问题提供了一些线索，黄曲霉素对饲料玉米的污染造成了每年2.25亿美元的损失和额外价值400万美元的牲畜死亡。 由于伏马菌素的污染，猪增重的减少在美国造成了1.47亿美元的损失。

大多数的损失估算仅限于少数几个国家对黄曲霉毒素和伏马菌素的预估。 由此可知，在全球范围内其它真菌毒素和作物对牲畜造成的损失将翻倍。